A letétkezelő az alapkezelőtől függetlenül működő hitelintézet, elsődleges szerepe, hogy az alap értékpapírjai a letétkezelőnél kerülnek elhelyezésre, amikkel az alapkezelők csak a letétkezelő engedélyével hajthatnak végre tranzakciókat. Ezen kívül a letétkezelő egyrészt fontos feladatokat lát el a befektetési alapok napi működtetésében, többek közt vezeti a befektetésekhez kapcsolódó értékpapír- és pénzforgalmi számlát és megállapítja a nettó eszközértéket, illetve az egy jegyre jutó nettó eszközértéket, másrészt biztosítja a befektetési alapok törvényi szabályozásnak megfelelő működését (ellenőrzi a kezelési szabályzatban és a törvényben foglaltaknak való megfelelést, ezek sérülése esetén írásban értesíti az alap kezelőjét, szükség esetén a MNB-t).